Федеральное государственное бюджетное учреждение «Клиническая больница» проводит и собственные научные исследования, совершенствуя лечебно-диагностический процесс.

На базе нашей клинической больницы работают кафедры ведущих институтов и университетов России. На наших кафедрах проводится постдипломное обучение врачей, обучение выпускников клинической ординатуры в очной и заочной аспирантурах с целью поддержки защиты диссертационных работ; проведение курсов повышения квалификации врачей, проходящих на договорной или бесплатной основе с выдачей квалификационного сертификата.

Сотрудничество с кафедрами ведущих институтов и университетов Российской Федерации делают применяемые в Федеральном государственном бюджетном учреждении «Клиническая больница» Управления делами Президента Российской Федерации методы лечения и диагностики самыми передовыми и наиболее эффективными.

На базе Федерального государственного бюджетного учреждения «Клиническая больница» Управления делами Президента Российской Федерации работают:

• кафедра кардиологии ФУВ РГМУ (профессор, д. м. н. Шевченко О. П.);
• кафедра анестезиологии и реаниматологии (д. м. н. Пасечник И. Н.);
• кафедра хирургических болезней педиатрического факультета ГОУ ВПО РГМУ РОСЗДРАВА (член-корреспондент РАМН, профессор, д. м. н. Затевахин И. И.);
• кафедра колопроктологии (директор Института колопроктологии, академик РАМН, профессор, д. м. н. Воробьев Г. И.);
• кафедра гинекологии и перинатологии (академик РАМН, профессор, д. м. н. Кулаков Г. И.);
• кафедра травматологи, ортопедии и ВПХ РГМУ им. Н. И. Пирогова (профессор, д. м. н. Скороглядов А. В.)
• кафедра неврологии РГМУ им. Н. И. Пирогова (академик РАМН, профессор, д. м. н. Гусев Е. И.);
• кафедра пульмонологии (директор НИИ Пульмонологии, академик, профессор, д. м. н. Чучалин А. Г.);
• кафедра клинической лабораторной диагностики РГМУ (профессор, д. м. н., Тогузов Р. Т.);
• кафедра педиатрии РМАПО (профессор, д. м. н. Коровина Н. А.);
• кафедра Московского НИИ педиатрии и детской хирургии (профессор, д. м. н. Розинов В. М.)

В диагностически сложных случаях для консультации терапевтических пациентов привлекаются ведущие специалисты профильных институтов — академик РАМН, профессор, д. м. н. Воробьев А. И., академик РАМН, профессор, д. м. н. Дедов И. И. и др.